1. 丙稀酰胺;
2. 双-丙稀酰胺;
3. Immobiline II;
4. 过硫酸铵;
5. TEMED
1. 溶解14.55g丙稀酰胺和0.45g N,N‘-双甲叉丙稀酰胺于40ml双蒸水中,溶解过滤后定容至50ml,4摄氏度可以存放2周。
2. Immobiline II,使用前将储存于4-8摄氏度的Immobiline II溶液于室温下平衡半小时。
固定化电解质可以分为酸性和碱性固定化电解质,分别含有一个弱的羧基和氨基,商品化的固定化电解质有6-7种,但是实验室已可合成不同pK值的丙稀酰胺衍生物17种,利用不同pK固定化电解质的组合可以配置不同pH范围的凝胶,甚至一个pH范围及小于一个pH范围的凝胶,现在已经可以从10种不同pK的固定化电解质中选择缓冲离子和滴定剂,设计pH2.5-12任意宽窄范围的pH配方,也有很多中pH范围商品化的固相pH梯度凝胶出售。
酸性溶液体积(ul)
2 F3 y3 f7 G H* z# [$ q9 j | 碱性溶液体积(ul)7 h* Z; ^3 [% T
|
0.2M固定化电解质pK8 U6 _" g1 h7 o. D+ q
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|
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| 6.2
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| 8.5
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| pH范围
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| 4.6
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0 S# {7 `# f. l; p. v% F5 Z, d | 9.3 e7 u% m3 @6 {, {- G# M
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299( |8 z. B- Q [5 G1 s
| 223
, M3 |9 t- Q& z/ i5 Q" b5 S | 157
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| 212- r& e: y S" f
| 3107 f' q7 ?2 _0 `/ [2 R
| 465
1 p: ^1 y$ R2 \- \' _* t |
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| 99
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|
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| 390
5 P6 ~ I5 v0 Z. G5 h/ H | 521% f) H. l2 M0 [6 n) y5 @) H
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1 T( J+ K2 m { |
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| 235! O0 G( F5 Z6 \ g3 z& w4 e" B
| $ U2 t6 z" B# }; p' U r; X
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|
69
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| 414
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| 3 ?- h Z, Y" Y* |* ~ }- \
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, E1 V# B' f' s |" B | 219+ [ d; Y+ V) K# a, ?0 m) O6 |0 E
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|
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| 323
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| 174
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| 3293 I+ b! ~' d6 F" x* z' m, z
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|
399
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| 1517 p9 R$ C# W. e: ^, k
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| 212
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| 232
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| 147
: R# u2 `) ~: M* P& M8 u: v | 424
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563
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| 298. u k7 A8 g/ R8 J
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| 2270 ]/ k2 @$ G, X' [
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| 34
; E z( I+ b( |. L! A | 4202 ~' v) C& k$ O4 Z
| 310
! G$ U; L- l) `: L2 j h2 l | 273
: b8 P3 a4 L: k0 B' s4 j: X; N& x |
1102
/ _4 m x. B" |" u$ t) I | ; E) ^6 V% x, L( {$ g& q
| 455
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f g& R; h- v' i9 H* {# u | 334, `$ o" H- Z+ l* f* p0 h4 |) k M
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8 A- v2 }* P9 u6 t( ]6 { | 4.0-10.0. q+ g4 n) ]$ Y& @
|
. J9 X7 d. D* {6 |0 _0 j- [- o | 114
& [6 L! Y* I7 ?4 J/ K. {# K | 50
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- ?' e7 ?4 H% A3 K' X | 157
7 w$ g0 m1 B/ }) ~% v( J. n | 357) ?9 ^. G, [% C$ e$ P( J0 \ o3 O
|
1. 组装灌胶器,灌胶前梯度混合器的腔间阀和流出管的夹子都应该关闭;
2. 将7.5ml(视凝胶大小而定)轻液(碱性)注入梯度混合的贮液腔,小心打开腔间阀,赶去腔间气泡,再关上腔间阀;
3. 将同样体积的重液注入梯度混合器的混合腔,两腔中分别放入同样大小的搅拌子,在贮液腔放入补偿棒,此时两腔中液面应相平;
4. 将梯度混合器置于磁力搅拌器上,将流出管插入灌胶模具中央,梯度混合器的出口与流出管末端高度应该相差5cm,磁力搅拌器转速为200-500r/min;
5. 两个腔中加入TEMED,然后加入过硫酸铵,打开流出管的夹子,当酸液流到流出管的一半时,打开腔间阀,两腔液面同时下降,在混合腔混匀后缓缓注入垂直放置的模具中;
6. 灌注完毕后,室温静置5-20min(可用异丙醇封胶)于50度烘箱中聚合,灌胶后立即洗净梯度混合器,以免堵塞腔间阀;
7. 聚合约需要1h,完成后,取出凝胶,标上正负极;
8. 将凝胶称重后放入双蒸水中(6×10min或3×1h),室温下60次/分震摇以洗去催化剂和未聚合的单体;
9. 用冷风吹胶至于洗胶前重量相差小于1%。
固相pH梯度等电聚焦的样品处理方法同载体两性电解质等电聚焦的样品处理方法基本相同,而且要求比载体两性电解质等电聚焦的样品处理方法还要低,由于pH梯度在凝胶中已经固定,所以样品中的盐对pH梯度影响不大。
固相pH梯度等电聚焦通常为水平电泳,没有垂直电泳的加样孔,由于每个蛋白质被浓缩在其等电点位置,理论上将样品加在凝胶中的任意位置均能得到相同结果,但实际操作还是应避免将样品加在紧靠电极的位置或靠近等电点的位置。
1. 打开循环水浴,设置冷却温度为10度;
2. 将固相pH梯度凝胶铺在冷却板上,在凝胶和冷却板之间可涂以液体石蜡或煤油以避免气泡产生,使二者之间接触良好;
3. 参见下表选择合适的电极液,以电极液润湿滤纸电极条,分别置于凝胶的酸、碱侧:
4. 将样品加在凝胶上;
5. 将白金电极分别放在滤纸电极条的中心,再将阳极和阴极分别同电源的正、极相连;
6. 接通电源,按照下表参数进行聚焦电泳
确定pH梯度。固相pH梯度凝胶导电性很低,无法像载体两性电解质凝胶那样利用电极测定pH,对于宽范围的固相pH梯度可以利用等电点标准品来测定;窄范围的pH梯度可依据根据线性关系推算pH值及蛋白质等电点。