DNA提取其他方法
* i4 q' [* x# a1 Z% T. B. [适用于PCR研究的快速提取法:2 A7 ?# ]5 c1 p, ]
试验步骤: ~" q% D! q, `0 T) n
1、 田间剪取植株新鲜叶片5-10mg(约2cm长)左右,新鲜叶片放于15ml离心管中,存于冰盒中,根据样品号贴上相应的标签。
$ r0 Z" I0 \6 V# d% o+ H* A
2、 用剪刀将叶片组织剪细(约0.5cm长)放在点穴式研板中。加入400μl DNA提取缓冲液,用玻棒将叶组织研细,直到液体变成深绿色即可。
" v0 O3 H+ l' I5 v! L+ ^
3、 加400μl DNA提取缓冲液,混合均匀,转入一新的15ml离心管(贴上相应的编号)。
& w6 X5 [0 o9 \ G1 }% C" R5 Z
4、 加400μl氯仿,混合均匀后,2400转离心30s,将上清液转入一支新的15ml离心管(贴上相应的编号)。
/ Q. V: {: R) n: A; T& Y
5、 加800μl无水乙醇,混匀,2400转离心3min。弃上清。70%乙醇冲洗,风干。用50μl TE缓冲液溶解,存于-20℃。取1μl用于PCR分析。
% m4 l1 E& ~; {! Y; _( t( H' L x1 B; c, \! b' f- X# ^# d
Chelex-100法提取DNA:
1 R w; u/ d- x2 _试验原理:, N+ r5 }( q+ N1 r& U- {! B
Chelex-100是一种化学螯合树脂,由苯乙烯、二乙烯共聚体组成。含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,对高价金属离子有很高的亲合力和螯合作用。在低离子强度、碱性及煮沸条件下,可以使细胞膜破裂,并使蛋白质变性,DNA游离。Chelex-100特别适用于微量生物样本的处理,方法简便快速,提取过程始终在同一管中进行,不用转移,可减少DNA的损失,操作步骤简化,减少了污染的机会。
( y9 h1 t8 d$ n以血液为例实验步骤:4 ^0 `2 H% m9 e% B
1、 取血液1-3?l,置1.5ml离心管中,加灭菌双蒸水1ml,振荡混匀,室温30min,或置冰箱-20℃ 5min。
7 U7 f4 n$ Q) d; z0 C3 ]3 ^( T2、 10000r/min离心5min,弃上清,反复2-3次。
5 b+ m; k3 |: a$ ~; Z' n4 x3、 于沉淀中加入200?l悬浮好的5%的Chelex-100溶液,56℃水浴2h或37℃水浴过夜。
; J9 ?/ C* S1 H P
4、 振荡5-10秒,置100℃ 5-10min,取出振荡溶液5-10s。
2 X5 ?: o. n) H2 r0 T5、 10000r/min 5min,上清液即可作为PCR反应的DNA模板。
3 t) h. u+ o; ^9 O6 x
注意事项:% a+ t7 S/ g k- Y: |% e
1、 Chelex-100处理模板仅适用于PCR反应,处理液不宜长期保存,如果保存的时间稍长,可将上清液转移至另一管中保存备用。一般在一周内使用,如果保存时间过长则会影响PCR扩增结果。
: m7 @# h& ^7 O; _& Z2、 在处理模板的各个步骤中,振荡要充分。
5 v. d$ a" Q. R$ u2 l# ~0 |* }6 Q5 L9 g
3、 煮沸的温度、时间要充分,否则将影响扩增。
z& [- D6 v* e% @$ `% {4 { I9 Y4、 使用前要混匀离心,取上清液作为模板,如果PCR反应体系中含有Chelex-100,Mg2+会被螯合,降低酶活性,使PCR扩增失败。
8 Q) t5 O! {4 K0 O* _
- E4 b% U6 ^0 l+ y4 d; q" O/ \% _& s) n硅珠法提取DNA:; [) @1 Z& r- @; u% V
试验原理:4 J M$ R* W: I! F
在高浓度的硫氰酸胍存在的条件下,DNA能够被二氧化硅特异性吸附,当没有硫氰酸胍存在时,DNA又可从二氧化硅中释放出来。硫氰酸胍是一种高性能的蛋白变性剂,可以使蛋白质与DNA充分分离,在硅珠吸附前高速离心可以将变性的蛋白质及一些不溶的物质除去。吸附后的漂洗过程则可将溶液中的PCR抑制物洗去。
1 A- K; [) a: d2 H1 J( ^
试验试剂:
( f5 J, [/ M+ ~( R1、 吸附剂:12g GuSCN溶于10ml 0.1mol/L Tris-HCl(pH6.4),0.8ml 0.5mol/L EDTA,0.5ml TritonX-100。
& I/ C: X% b) ]3 i* K; w2、 漂洗剂:12g GuSCN溶于10ml 0.1mol/LTris-HCl(pH6.4)。
) l- x g/ O# D7 c S# F3、 硅珠悬浮液:0.06g Silica溶于1ml灭菌超纯水。
- D0 F1 p% _/ v+ s8 J
4、 TES:1ml1mol/L Tris-HCl pH8.0,2ml 5mol/L NaCl,2ml 0.5mol/L pH8.0 EDTA,95ml灭菌超纯水。
2 e/ ?" e: Q5 v
试验步骤:
0 m' p$ ^8 [4 d& x$ `5 W1 L1、 取1.5ml离心管1支,加入TES200ul,10%SDS40?l再加入血液2-4?l,混匀,煮沸5min。
6 L# F& h2 j- f& ?( Q: p. c2、 振荡混匀,加入300-600?l吸附液,混匀。
+ T% B$ a* z. W z8 Y8 b$ _$ ^# u3、 加入20-40?l硅珠悬浮液,振荡混匀,置室温15min,振荡5s,10000r/min离心2min。
7 p' {" W: c8 z5 X+ B9 R' V4、 除去上清,于沉淀中加入200-400?l漂洗液,充分悬浮沉淀物,10000r/min离心1min。
, v& d+ \& b+ o, E- c* K
5、 去上清液,重复漂洗一次,去上清后沉淀物用70%乙醇漂洗1-2次。10000r/min 5min。
1 a2 J0 Y4 Q5 n$ p; c( c$ Y0 K
6、 去乙醇,置56℃ 10min,于沉淀中加入50-100?lTES,旋涡混合30s,56℃保温10min。
5 M- J9 }) I) r- E1 U* S; G7、 10000r/min离心10min,上清液可直接用于PCR反应。
k& [/ o R7 P2 x, U7 S1 O" P8 {
固相吸附法提取DNA:
: j7 J4 q) O2 q- Y0 g2 y试验原理:8 ^8 L5 g# J- L* _ d$ A
硫氰酸胍具有溶解细胞和灭活核酸酶的性质,利用当硫氰酸胍存在时硅藻颗粒能特异性吸附DNA,而当去除硫氰酸胍时,DNA又能从硅藻上释放出来的特性,来提取样本中的DNA。该方法尤其适用于临床标本的DNA提取。
. s/ q2 a7 U ]+ |
试验试剂:$ Z# T6 b% N/ h5 H; k, N8 c. o1 i6 c2 \
1、 裂解液:12g GuSCN,10ml 0.1mol/L Tris-HCl pH6.4,2.2ml 0.2mmol/L EDTA pH8.0,0.3ml TritonX-100。
9 p3 ]1 w4 P t. f: G4 S) T
2、 洗涤液:12g GuSCN,10ml 0.1mol/L Tris-HCl pH6.4。
2 F# \( ?7 F7 `
试验步骤:
0 f5 U9 F$ w. L, h# h' @, m/ h1、 取100?l样品加900ul裂解液,20?l硅藻液,振荡混合,10000r/min离心1min,去上清。
- {0 |6 [' U9 y# w2、 加1ml洗涤液,悬浮沉淀洗涤,10000r/min离心1min,再重复一次。加1ml 70%乙醇洗一次,1ml丙酮洗一次,去上清,56℃ 10min。
8 H# b0 b; a' v. l+ Q+ F* d1 c
3、 加60?l TE缓冲液混匀,56℃ 10min,10000r/min离心5min,上清液备用。