DNA提取其他方法
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适用于PCR研究的快速提取法:
; x7 I8 o; d, C5 g& K试验步骤:
/ K5 J! |! a- b& F, U" r& O1、 田间剪取植株新鲜叶片5-10mg(约2cm长)左右,新鲜叶片放于15ml离心管中,存于冰盒中,根据样品号贴上相应的标签。
) o( Q5 B" P, ]8 i% N6 U) {$ f2、 用剪刀将叶片组织剪细(约0.5cm长)放在点穴式研板中。加入400μl DNA提取缓冲液,用玻棒将叶组织研细,直到液体变成深绿色即可。
& ]/ B, ]! d. D. d$ [% o3、 加400μl DNA提取缓冲液,混合均匀,转入一新的15ml离心管(贴上相应的编号)。
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4、 加400μl氯仿,混合均匀后,2400转离心30s,将上清液转入一支新的15ml离心管(贴上相应的编号)。
. ?: A1 k. C, o$ V5、 加800μl无水乙醇,混匀,2400转离心3min。弃上清。70%乙醇冲洗,风干。用50μl TE缓冲液溶解,存于-20℃。取1μl用于PCR分析。
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, e& g" B- Q4 x2 T. Z) C/ kChelex-100法提取DNA:' s" G2 R( c) ?5 F3 l5 k+ s
试验原理:
' Y3 f/ g/ t) ]) l$ k0 u# m f Chelex-100是一种化学螯合树脂,由苯乙烯、二乙烯共聚体组成。含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,对高价金属离子有很高的亲合力和螯合作用。在低离子强度、碱性及煮沸条件下,可以使细胞膜破裂,并使蛋白质变性,DNA游离。Chelex-100特别适用于微量生物样本的处理,方法简便快速,提取过程始终在同一管中进行,不用转移,可减少DNA的损失,操作步骤简化,减少了污染的机会。
: N9 d5 z- [7 D/ R; n& F以血液为例实验步骤:4 @3 f" f5 [8 O; K4 [
1、 取血液1-3?l,置1.5ml离心管中,加灭菌双蒸水1ml,振荡混匀,室温30min,或置冰箱-20℃ 5min。
! r6 m3 ^: W& C" _( ? R6 y; N2、 10000r/min离心5min,弃上清,反复2-3次。
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3、 于沉淀中加入200?l悬浮好的5%的Chelex-100溶液,56℃水浴2h或37℃水浴过夜。
, A3 I* _- I0 B& P4、 振荡5-10秒,置100℃ 5-10min,取出振荡溶液5-10s。
, [& |1 G3 F; @6 v" T9 I/ n9 g5 R5、 10000r/min 5min,上清液即可作为PCR反应的DNA模板。
! p- G( }# X9 E注意事项:
1 M: x% A- X5 C4 j1、 Chelex-100处理模板仅适用于PCR反应,处理液不宜长期保存,如果保存的时间稍长,可将上清液转移至另一管中保存备用。一般在一周内使用,如果保存时间过长则会影响PCR扩增结果。
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2、 在处理模板的各个步骤中,振荡要充分。
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3、 煮沸的温度、时间要充分,否则将影响扩增。
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4、 使用前要混匀离心,取上清液作为模板,如果PCR反应体系中含有Chelex-100,Mg2+会被螯合,降低酶活性,使PCR扩增失败。
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4 A3 ?: k) b7 r9 O硅珠法提取DNA:1 { G4 C* ^, n1 Z; ?- Q) w8 H# L
试验原理:
$ R' ?7 B2 N: t/ d* y. J, J! s, d 在高浓度的硫氰酸胍存在的条件下,DNA能够被二氧化硅特异性吸附,当没有硫氰酸胍存在时,DNA又可从二氧化硅中释放出来。硫氰酸胍是一种高性能的蛋白变性剂,可以使蛋白质与DNA充分分离,在硅珠吸附前高速离心可以将变性的蛋白质及一些不溶的物质除去。吸附后的漂洗过程则可将溶液中的PCR抑制物洗去。
% F' X" Z0 L* I9 ^' Y' D试验试剂:
/ \; I8 U. D& {, ^( I1、 吸附剂:12g GuSCN溶于10ml 0.1mol/L Tris-HCl(pH6.4),0.8ml 0.5mol/L EDTA,0.5ml TritonX-100。
, [ A! E5 n5 m5 F K ?1 H0 m2、 漂洗剂:12g GuSCN溶于10ml 0.1mol/LTris-HCl(pH6.4)。
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3、 硅珠悬浮液:0.06g Silica溶于1ml灭菌超纯水。
q7 \, `& E* k( d. q9 D4、 TES:1ml1mol/L Tris-HCl pH8.0,2ml 5mol/L NaCl,2ml 0.5mol/L pH8.0 EDTA,95ml灭菌超纯水。
2 s+ A' f! y. i/ [/ s) M3 \8 B试验步骤:
# t$ X- f ~( f1 }9 g1、 取1.5ml离心管1支,加入TES200ul,10%SDS40?l再加入血液2-4?l,混匀,煮沸5min。
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2、 振荡混匀,加入300-600?l吸附液,混匀。
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3、 加入20-40?l硅珠悬浮液,振荡混匀,置室温15min,振荡5s,10000r/min离心2min。
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4、 除去上清,于沉淀中加入200-400?l漂洗液,充分悬浮沉淀物,10000r/min离心1min。
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5、 去上清液,重复漂洗一次,去上清后沉淀物用70%乙醇漂洗1-2次。10000r/min 5min。
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6、 去乙醇,置56℃ 10min,于沉淀中加入50-100?lTES,旋涡混合30s,56℃保温10min。
7 T: f5 k: b) [1 Z$ e" ?$ z2 T7、 10000r/min离心10min,上清液可直接用于PCR反应。
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固相吸附法提取DNA:
4 S+ d" K4 n. k: p试验原理:
' ~# b7 `1 k6 D$ ?' c" H 硫氰酸胍具有溶解细胞和灭活核酸酶的性质,利用当硫氰酸胍存在时硅藻颗粒能特异性吸附DNA,而当去除硫氰酸胍时,DNA又能从硅藻上释放出来的特性,来提取样本中的DNA。该方法尤其适用于临床标本的DNA提取。
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试验试剂:" C: E' U+ Q M% |% V! g
1、 裂解液:12g GuSCN,10ml 0.1mol/L Tris-HCl pH6.4,2.2ml 0.2mmol/L EDTA pH8.0,0.3ml TritonX-100。
1 G* S* J: @; I) e4 p# ]0 N2、 洗涤液:12g GuSCN,10ml 0.1mol/L Tris-HCl pH6.4。
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试验步骤:
1 K( M' W6 h; v1、 取100?l样品加900ul裂解液,20?l硅藻液,振荡混合,10000r/min离心1min,去上清。
$ [& F5 {$ ~; D2、 加1ml洗涤液,悬浮沉淀洗涤,10000r/min离心1min,再重复一次。加1ml 70%乙醇洗一次,1ml丙酮洗一次,去上清,56℃ 10min。
6 f* N6 d! x# T1 F# j3、 加60?l TE缓冲液混匀,56℃ 10min,10000r/min离心5min,上清液备用。