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【原创】序列分析、编辑四宝之氨基酸及其密码子对照

本主题由 小宝 于 08-7-23 11:39 移动 
武林三国

【原创】序列分析、编辑四宝之氨基酸及其密码子对照

 

氨基酸及其密码子对照

Alanine

Ala

A

GCU, GCC, GCA, GCG

Arginine

Arg

R

CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG

Asparagine

Asn

N

AAU, AAC

Aspartic acid

Asp

D

GAU, GAC

Cysteine

Cys

C

UGU, UGC

Glutamine

Gln

Q

CAA, CAG

Glutamic acid

Glu

E

GAA, GAG

Glycine

Gly

G

GGU, GGC, GGA, GGG

Histidine

His

H

CAU, CAC

Isoleucine

Ile

I

AUU, AUC, AUA

Leucine

Leu

L

UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG

Lysine

Lys

K

AAA, AAG

Methionine

Met

M

AUG

Phenylalanine

Phe

F

UUU, UUC

Proline

Pro

P

CCU, CCC, CCA, CCG

Serine

Ser

S

UCU, UCC, UCA, UCG, AGU,AGC

Threonine

Thr

T

ACU, ACC, ACA, ACG

Tryptophan

Trp

W

UGG

Tyrosine

Tyr

Y

UAU, UAC

Valine

Val

V

GUU, GUC, GUA, GUG

Start

 

 

AUG *

Stop

 

 

UAG (amber), UGA (opal), UAA (ochre)

TOP



【原创】序列分析、编辑四宝之单个碱基及其字符对照

 

单个碱基及其字符对照

A

Adenine

C

Cytosine

G

Guanine

T

Thymine

U

Uracil (RNA)

 

B

C, G, or T

D

A, G, or T

H

A, C, or T

K

G or T

M

A or C

N

A, T, C, or G

R

A or G

S

C or G

V

A, C, or G

W

A or T

Y

C or T

 

TOP


武林三国

【原创】序列分析、编辑四宝之常用抗原决定基标记

 

常用抗原决定基标记

Common Epitope Tags

Tag

Protein Sequence

DNA Sequence

FLAG

DYKDDDDK

GAC TAC AAA GAC GAT GAC GAC AAG

HA

YPYDVPDYA

TAC CCA TAC GAT GTT CCA GAT TAC GCT

His

HHHHHH

CAC CAC CAC CAC CAC CAC

Myc

EQKLISEEDL

GAA CAA AAA CTC ATC TCA GAA GAG GAT CTG

Due to the degenerate nature of the genetic code, the given sequence is one of a number of sequences that can encode the same epitope tag.

TOP



【原创】序列分析、编辑四宝之常用限制性酶及其酶切位点

 

常用限制性酶及其酶切位点

AatII

GACGT C

AflII

C TTAAG

AgeI

A CCGGT

ApaI

GGGCC C

ApaLI

G TGCAC

AseI

AT TAAT

BamHI

G GATCC

BclI

T GATCA

BglII

A GATCT

BstBI

TT CGAA

ClaI

AT CGAT

DraI

TTT AAA

EagI

C GGCCG

EcoRI

G AATTC

EcoRV

GAT ATC

FspI

TGC GCA

HindIII

A AGCTT

HpaI

GTT AAC

KpnI

GGTAC C

NarI

GG CGCC

NcoI

C CATGG

NdeI

CA TATG

NheI

G CTAGC

NotI

GC GGCCGC

NruI