[质粒图谱] pCAMBIA-1391Z质粒图谱及相关信息

pCAMBIA-1391Z质粒图谱及相关信息
( i- q+ A) V  ~& Y+ ~! M+ @( V4 H0 q8 Q4 r6 ^- H* ?* ^0 }' x- q8 [
图谱库ID：
5 |' O& B5 r# u/ b4 f' R! H' w& C$ x8 }8 J( W8 S+ L
质粒名称：pCAMBIA-1391Z
9 `9 c3 y, y3 R' o9 v
' C! ]( I2 R. D, z3 Q载体类型：Bacterial
& K+ U$ c& w8 y0 @! l$ z
3 P" i8 H8 T7 L" N# `" W1 U. v报告基因：GUS 3 T; V$ w1 o$ v0 x  A9 S

- X$ ?9 c; |3 }) B启动子：CAMV35S   
; F) a% Z  v5 s# u7 r' M0 x
' U# g& @, I: r: [5 O. Q: Z1 v抗性： kan （菌）  hptII （植物）
+ h4 o0 m" y7 p: w
5 A' v0 x; i% _& R7 g2 `( Z" apCAMBIA-1391Z图谱1：
0 v% K7 \8 _0 ~8 ]3 P8 Y" W9 D( _+ F

, H: k& i" X  }" [. `9 j
4 \3 j/ _; q- W
pCAMBIA-1391Z图谱2：  I- K8 Z' v+ ]; e8 r) T

3 p2 \8 I3 v! L/ c* l  v2 [/ M& w4 _1 x

( Y% s! L5 n. V$ t/ l! X7 J* ^+ V: f' k" @. [
pCAMBIA-1391Z图谱3：
, }; \( m2 C! k3 {/ ^4 n2 m& x% u- m

$ s  w) f, }2 c* ?
( _: U2 C; V* Q. n( J6 VpCAMBIA-1391Z序列及特征信息：1 h& D& ?, F% X; l, A6 N

5 _. e0 a' p$ [2 uLOCUS       AF234312               11226 bp    DNA     circular SYN 24-APR-2000, a6 U/ ?6 A! Y# ]
DEFINITION  Binary vector pCAMBIA-1391Z, complete sequence.# l5 x9 E9 U6 ~: t7 k
ACCESSION   AF234312
5 I9 g% ~. t! P' n  b( [8 ^1 TVERSION     AF234312.1  GI:7638131
1 x7 p( _: V" s2 a8 v' H! x6 q9 WKEYWORDS    .
  O% T* e  k9 CSOURCE      Binary vector pCAMBIA-1391Z8 j' ]1 R) P3 e+ d# M) D
  ORGANISM  Binary vector pCAMBIA-1391Z$ R: p: T' P3 Z  ?2 k) Z
            other sequences; artificial sequences; vectors.
% k% i" A. i! g- H1 f1 w7 ZREFERENCE   1  (sites)5 R+ N% m/ a) u: {9 O# l
  AUTHORS   Hajdukiewicz,P., Svab,Z. and Maliga,P.
& C# O4 y, e; @! q: D# @0 w2 P  TITLE     The small, versatile pPZP family of Agrobacterium binary vectors
6 ^& ]  ^( F9 ]4 n            for plant transformation
- R4 K1 K# {2 U. ]" R  JOURNAL   Plant Mol. Biol. 25 (6), 989-994 (1994)
% \0 J+ x8 v- U+ n5 S" F8 ]0 q% e   PUBMED   79192186 v1 W9 |+ Z8 `1 x% s. D
REFERENCE   2  (bases 1 to 11226)7 z) T: M9 K  v. `! \; q5 ~
  AUTHORS   Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W.,
" \7 n0 y1 w# K9 f3 a            Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L.,0 J5 e& h) V. @0 L, W+ t
            Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z.,7 Z8 F' q, {/ S6 F9 L) h
            Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A.7 M' y% ]! ~! z& H
  TITLE     A comprehensive set of modular vectors for advanced manipulations$ p) `- X0 F3 {2 ]9 ?
            and efficient transformation of plants
$ ?( u+ I# R9 I. y! f0 |! {( W  JOURNAL   Unpublished
% y1 i* E0 f$ U4 u* U4 z/ T  REMARK    Full description of constructs$ ^- l& ?' C4 Y1 q7 e* u
REFERENCE   3  (bases 1 to 11226)
9 Y  i. E- s+ _7 R: ^6 K  AUTHORS   Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W.,
* F% j: w, Y( m* I# R6 l' R            Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L.,- T! H" w( L/ }
            Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z.,
9 z& x: M. U9 j/ O            Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A.1 p: p  ~$ P3 K* D) x$ w
  TITLE     Direct Submission
# P# L/ M; {7 d6 Q( n  JOURNAL   Submitted (15-FEB-2000) CAMBIA, Clunies Ross St, Black Mountain /
5 j' s, ]) M, i. F% d' u- E            GPO Box 3200, Canberra, ACT 2601, Australia5 X) F! z/ L+ E& \' {
FEATURES             Location/Qualifiers
) \' d2 f" c) B9 Y     source          1..112260 B% L% I! ]+ `+ B' ~. E- C
                     /organism="Binary vector pCAMBIA-1391Z"
! r0 h' G; q* F9 {6 V0 }* r6 H8 I                     /mol_type="other DNA"
, n" p( x9 g, j* m% h                     /db_xref="taxon:118404"" R0 t# x* |, L. S
     CDS             join(2..16,207..2054)
0 W5 p# T) V8 V$ `% N                     /codon_start=1
/ i. L' a$ k8 L5 c5 f7 t/ w                     /product="GUSA, hexaHis tagged"0 r- ~2 p! ?- T
                     /protein_id="AAF65390.1"/ K  R* g) K$ v( w8 c
                     /db_xref="GI:7638135"
1 m; ?( T1 ^6 T- a1 \                     /translation="MVDLRNRRLVRPVETPTREIKKLDGLWAFSLDRENCGIDQRWWE
' ]+ k3 L* u6 F) t8 v                     SALQESRAIAVPGSFNDQFADADIRNYAGNVWYQREVFIPKGWAGQRIVLRFDAVTHY) R( B. p& w$ v+ {
                     GKVWVNNQEVMEHQGGYTPFEADVTPYVIAGKSVRITVCVNNELNWQTIPPGMVITDE
' e4 N. z& A, S1 l6 x6 s& z6 w                     NGKKKQSYFHDFFNYAGIHRSVMLYTTPNTWVDDITVVTHVAQDCNHASVDWQVVANG9 K( J4 H: n9 }' q5 \# ]
                     DVSVELRDADQQVVATGQGTSGTLQVVNPHLWQPGEGYLYELEVTAKSQTESDIYPLR
/ p4 k( [! z4 l                     VGIRSVAVKGQQFLINHKPFYFTGFGRHEDADLRGKGFDNVLMVHDHALMDWIGANSY% L+ X' P* M; f& Y
                     RTSHYPYAEEMLDWADEHGIVVIDETAAVGFQLSLGIGFEAGNKPKELYSEEAVNGET" N$ g, n0 q" F
                     QQAHLQAIKELIARDKNHPSVVMWSIANEPDTRPQGAREYFAPLAEATRKLDPTRPIT- F( m) f; P, l
                     CVNVMFCDAHTDTISDLFDVLCLNRYYGWYVQSGDLETAEKVLEKELLAWQEKLHQPI& A# b" A6 r- L; f) h" B5 n
                     IITEYGVDTLAGLHSMYTDMWSEEYQCAWLDMYHRVFDRVSAVVGEQVWNFADFATSQ2 I" N! ]* R4 t
                     GILRVGGNKKGIFTRDRKPKSAAFLLQKRWTGMNFGEKPQQGGKQASHHHHHHV"
5 @" v+ R4 a4 u/ U$ p     exon            2..16
2 ]8 S* F2 c0 p, d                     /note="synthetic first gus exon (modular)". \. t2 k) Z! h
     intron          17..2065 `: t" I- S- D; l; P/ z: n
                     /note="Castorbean catalase intron; modified"
7 p: O& v/ n4 F     exon            207..2054/ S6 [; B* J6 m# q" l' ]) R& I. L
                     /note="second gusA exon, His6"/ d( c& B3 k$ x4 ]7 M2 N/ L
     misc_feature    2086..23380 Y+ a. E, k6 J- Y
                     /note="nos (nopaline synthase) 3'UTR (polyA signal)"3 a, o* P6 A) S) J" I- m
     misc_feature    2376..24017 b" C/ ^: x: ^# ]+ b9 D
                     /note="right border T-DNA repeat"4 h7 e5 v" s- z0 a  s- A5 @* G
     misc_feature    complement(3442..4442)  D3 W+ }  S4 F7 l" ]: {) {
                     /note="STA region from pVS1 plasmid"
5 W, C! _: g; `! m' W, v6 M     rep_origin      complement(5035..6035)
0 K% L% w7 v& \2 _. F* r7 t/ Z                     /note="pVS1-REP; replication origin from pVS1"
, c5 \5 ?3 w7 j% G; _$ e     misc_feature    complement(6445..6705)
5 q6 E' N- _# O) q                     /note="bom site from pBR322"% G7 E3 o0 A' Z# i; k, q3 B
     rep_origin      complement(6845..7125)- x- _8 Y6 _9 O6 F; @  V
                     /note="pBR322 origin of replication"$ i# {+ T; [- s; ?" q* [! ~
     CDS             complement(7416..8210)+ ]& ^) g4 ?0 l" k' Y* B/ R
                     /note="aadA (kanamycin resistance) gene amplified from- U5 C8 _. N+ n$ K
                     pIG121Hm"
. W4 f6 k" h# `7 z6 r: G                     /codon_start=15 H% w, ~- y/ Z( i
                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"6 y" Y* L3 e6 N! j% X
                     /protein_id="AAF65388.1"/ X4 i# [9 ]$ T' t
                     /db_xref="GI:7638133"
( f- K: K: Y( _( q# Y' N                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLK
. M7 j; @8 j7 F$ U" D  ?) u: h+ N- r                     MTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEY
9 C. x5 _; E6 u! x/ G4 [                     EDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWE
: F) F) R. J6 Y9 ?7 D3 Z                     EDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKW
7 g: `5 A6 i4 g2 ?- a# H+ |  x" P                     YDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"
7 e, Z, }! a4 Y     misc_feature    8635..8660
  S, V; i9 f* h3 B" u4 F                     /note="left border repeat from C58 T-DNA"4 X' A2 R6 `# Z# G# B
     misc_feature    8727..8935
8 h; m( y" }% Q/ L, ~6 w, P                     /note="CaMV 3'UTR (polyA signal)"' i- b+ r5 C: q6 U! i1 b) x
     CDS             complement(8951..9976)% ?9 a. f2 w' {4 e" Y
                     /note="hptII (hygromycin resistance) gene"- i; x2 d8 M8 I5 R6 V
                     /codon_start=1
+ U) v/ |  i: J* ~% c  M                     /product="hygromycin phosphotransferase"
. X; }9 x3 Q- f- o3 [9 z                     /protein_id="AAF65389.1"% w/ g4 v7 J8 y' C' E; c5 W" [
                     /db_xref="GI:7638134"+ j0 q$ h* ^) A4 l) N
                     /translation="MKKPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGR
& p) G6 J; a- i8 Y& G6 a# ~                     GYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQD
$ F: v7 K5 c, N; h                     LPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVY
1 ?5 F" s- N, j; E6 U+ [* \                     HWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWS' ^! j- O; D( y6 Y
                     EAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQ/ ?3 p$ y; V. v2 s6 N& D9 y
                     SLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPS
0 G1 x8 k) c4 j: x                     TRPRAKK"; u5 G: [' E5 p2 t' n  P, l
     promoter        10928..109828 X/ p1 U- _. R' o; t
                     /note="PlacZ; lacZ promoter"
% m- m, ~2 t: X$ B! |5 @. [' G6 h     CDS             11009..>11207
. P( M1 d2 ~$ s                     /codon_start=1% p: W% W' O+ C6 Q2 ?7 m( c
                     /product="LacZ alpha, truncated"  C, P" S1 k0 I  s3 t( m4 [
                     /protein_id="AAF65387.1"
% `: M4 i, T9 U8 X# V                     /db_xref="GI:7638132"
: L2 C$ M' y* {, b+ I2 E                     /translation="MTMITPSLAAGRRIPGNSLAVVLQRRDWENPGVTQLNRLAAHPP( {) |& `2 u- D+ G( T
                     FASWRNSEEARTDRPSQQLRSL"
; e1 D& L9 W! ?  j* w3 m* S     misc_feature    11026..110617 B- N, p( z: f3 H4 ?
                     /note="pUC9 MCS; polylinker"1 C* P; B$ m9 J
ORIGIN      
( t( A- m3 w, g        1 catggtagat ctgagggtaa atttctagtt tttctccttc attttcttgg ttaggaccct
9 _/ E. U& h6 B9 P  r       61 tttctctttt tatttttttg agctttgatc tttctttaaa ctgatctatt ttttaattga
/ c3 U1 y7 ]" ]9 u# ]. f      121 ttggttatgg tgtaaatatt acatagcttt aactgataat ctgattactt tatttcgtgt
+ m' y- p/ Q  u: T6 v      181 gtctatgatg atgatgatag ttacagaacc gacgactcgt ccgtcctgta gaaaccccaa% e& l1 h. r/ g+ R$ W
      241 cccgtgaaat caaaaaactc gacggcctgt gggcattcag tctggatcgc gaaaactgtg+ f7 {1 ]( ?, Y1 N/ [% R( @# J$ b
      301 gaattgatca gcgttggtgg gaaagcgcgt tacaagaaag ccgggcaatt gctgtgccag
9 S4 C$ s! C0 ]      361 gcagttttaa cgatcagttc gccgatgcag atattcgtaa ttatgcgggc aacgtctggt+ M4 q- w% q0 C8 T, D
      421 atcagcgcga agtctttata ccgaaaggtt gggcaggcca gcgtatcgtg ctgcgtttcg* l6 Z) [. m4 L3 U5 B# h
      481 atgcggtcac tcattacggc aaagtgtggg tcaataatca ggaagtgatg gagcatcagg+ c, a  G  m7 J& x) P
      541 gcggctatac gccatttgaa gccgatgtca cgccgtatgt tattgccggg aaaagtgtac$ `7 ^  h' V7 v9 A8 g: |6 N
      601 gtatcaccgt ttgtgtgaac aacgaactga actggcagac tatcccgccg ggaatggtga* j" h4 }, K( N  x. ~
      661 ttaccgacga aaacggcaag aaaaagcagt cttacttcca tgatttcttt aactatgccg
2 Z7 C& M' c: f      721 gaatccatcg cagcgtaatg ctctacacca cgccgaacac ctgggtggac gatatcaccg3 M# A& f. P6 f& |3 q
      781 tggtgacgca tgtcgcgcaa gactgtaacc acgcgtctgt tgactggcag gtggtggcca
' W$ p: t& y( q: [; V      841 atggtgatgt cagcgttgaa ctgcgtgatg cggatcaaca ggtggttgca actggacaag9 u5 p% T$ b( ^# ^' W2 V9 M+ @9 E
      901 gcactagcgg gactttgcaa gtggtgaatc cgcacctctg gcaaccgggt gaaggttatc! G: i$ Q  J1 o$ D& j/ t- m; \( j
      961 tctatgaact cgaagtcaca gccaaaagcc agacagagtc tgatatctac ccgcttcgcg$ ]. _/ |1 Q! L% g. r" T4 D# F) r
     1021 tcggcatccg gtcagtggca gtgaagggcc aacagttcct gattaaccac aaaccgttct
7 X5 |0 ?4 ?3 i3 q9 |: O) y     1081 actttactgg ctttggtcgt catgaagatg cggacttacg tggcaaagga ttcgataacg
$ q0 w4 i  v% ~. }" v     1141 tgctgatggt gcacgaccac gcattaatgg actggattgg ggccaactcc taccgtacct
. L3 _+ A- I! W; a     1201 cgcattaccc ttacgctgaa gagatgctcg actgggcaga tgaacatggc atcgtggtga& f2 O7 B2 ~  K/ W2 _! K
     1261 ttgatgaaac tgctgctgtc ggctttcagc tgtctttagg cattggtttc gaagcgggca0 R" O( _9 C# M* J8 U5 ^6 y8 I
     1321 acaagccgaa agaactgtac agcgaagagg cagtcaacgg ggaaactcag caagcgcact1 ]) e4 v/ l4 H9 d' b5 A7 @: p
     1381 tacaggcgat taaagagctg atagcgcgtg acaaaaacca cccaagcgtg gtgatgtgga
8 `0 |5 ~% E+ S! M" X( i     1441 gtattgccaa cgaaccggat acccgtccgc aaggtgcacg ggaatatttc gcgccactgg
9 E% }. r. F; m6 ^' z! M9 f     1501 cggaagcaac gcgtaaactc gacccgacgc gtccgatcac ctgcgtcaat gtaatgttct3 |7 A* Y0 j* |0 h; a8 `. V
     1561 gcgacgctca caccgatacc atcagcgatc tctttgatgt gctgtgcctg aaccgttatt
" J9 I9 R' o) ^     1621 acggatggta tgtccaaagc ggcgatttgg aaacggcaga gaaggtactg gaaaaagaac
; s! E; I, S5 h8 s8 g     1681 ttctggcctg gcaggagaaa ctgcatcagc cgattatcat caccgaatac ggcgtggata
$ Y* }; ~* a7 `0 F4 |  y5 b, _( n     1741 cgttagccgg gctgcactca atgtacaccg acatgtggag tgaagagtat cagtgtgcat# x; o0 h& \9 j( S8 V' q
     1801 ggctggatat gtatcaccgc gtctttgatc gcgtcagcgc cgtcgtcggt gaacaggtat* K. U+ n9 m4 d4 D
     1861 ggaatttcgc cgattttgcg acctcgcaag gcatattgcg cgttggcggt aacaagaaag
# y& K8 E- y6 K* A& A" n2 g! C     1921 ggatcttcac tcgcgaccgc aaaccgaagt cggcggcttt tctgctgcaa aaacgctgga# `3 ^7 T' D' a9 T! Y6 ?  H* N
     1981 ctggcatgaa cttcggtgaa aaaccgcagc agggaggcaa acaagctagc caccaccacc4 G$ j- [+ p. `3 _- v& N
     2041 accaccacgt gtgaattaca ggtgaccagc tcgaatttcc ccgatcgttc aaacatttgg
; c# Z, N8 f4 ^9 d     2101 caataaagtt tcttaagatt gaatcctgtt gccggtcttg cgatgattat catataattt
5 u# o) I3 \- L& @2 J$ R     2161 ctgttgaatt acgttaagca tgtaataatt aacatgtaat gcatgacgtt atttatgaga1 f6 C. R$ T4 O
     2221 tgggttttta tgattagagt cccgcaatta tacatttaat acgcgataga aaacaaaata7 B" y  V/ E6 k- `6 L! y
     2281 tagcgcgcaa actaggataa attatcgcgc gcggtgtcat ctatgttact agatcgggaa4 f7 h( F3 @4 f8 p' [, K# T3 O; ]
     2341 ttaaactatc agtgtttgac aggatatatt ggcgggtaaa cctaagagaa aagagcgttt
& q  ^( Y0 l1 C" b6 M3 f     2401 attagaataa cggatattta aaagggcgtg aaaaggttta tccgttcgtc catttgtatg4 {- F/ w7 s( J- k! |* J* L; j- O
     2461 tgcatgccaa ccacagggtt cccctcggga tcaaagtact ttgatccaac ccctccgctg
0 X! n1 K& d# T' F  W/ y+ ~5 n     2521 ctatagtgca gtcggcttct gacgttcagt gcagccgtct tctgaaaacg acatgtcgca  h0 u, b' r2 y6 |/ ~# U- ?. w
     2581 caagtcctaa gttacgcgac aggctgccgc cctgcccttt tcctggcgtt ttcttgtcgc
* L3 h) B. |8 x5 f% n% ]7 R, X3 ^) l     2641 gtgttttagt cgcataaagt agaatacttg cgactagaac cggagacatt acgccatgaa  }% \" z& X- H% @4 J: g4 f* p+ l; d
     2701 caagagcgcc gccgctggcc tgctgggcta tgcccgcgtc agcaccgacg accaggactt) U; k# F, X9 l& e" E/ k" b, }
     2761 gaccaaccaa cgggccgaac tgcacgcggc cggctgcacc aagctgtttt ccgagaagat
& z+ X* R% }5 l     2821 caccggcacc aggcgcgacc gcccggagct ggccaggatg cttgaccacc tacgccctgg
# f2 q& G4 k! g5 n$ S7 X) `     2881 cgacgttgtg acagtgacca ggctagaccg cctggcccgc agcacccgcg acctactgga
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     9421 cggcccaaag catcagctca tcgagagcct gcgcgacgga cgcactgacg gtgtcgtcca
$ M! p- D5 b) C: m* p     9481 tcacagtttg ccagtgatac acatggggat cagcaatcgc gcatatgaaa tcacgccatg
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