多序列比对后怎么进行同源性检测啊？！
我一点都不懂诶

请问楼主，我是一个新手。
用mega建立的系统发育树，下面有坐标，那代表什么意思？有什么含义？

请问，我在用phylip3.67构建进化树的过程中，当用drawtree.exe处理后，得到plotfile文件，把它改成.bmp格式，不能看，请达人指教，谢谢！

引用:

原帖由 glenn_007 于 08-5-2 11:02 发表
请问楼主，我是一个新手。
用mega建立的系统发育树，下面有坐标，那代表什么意思？有什么含义？

代表两者的遗传距离

引用:

原帖由 downsea 于 08-5-20 14:58 发表

代表两者的遗传距离

还是不太明白，哪两者的距离啊？坐标不是横着的吗？还可以自己设置。而序列是竖着排列的啊。
请版主详细解答一下吧。

引用:

原帖由 pczhuy 于 08-4-10 14:56 发表
多序列比对后怎么进行同源性检测啊？！
我一点都不懂诶

我也大胆来回答一个问题  我只知道可以用dnaman来检测同源性(要是没有说明书我也可以给你o(∩_∩)o...)别的就不知道了

再问个问题：构建进化树的时候有很多种选择，像NJ树 ME树 MP树等。我想问一下他们具体含义是什么啊。偶在百度里搜不到，就来问了，希望能有人回答

代表各序列之间的遗传距离

是由构建方法不同而形成的称呼吧！？
最大简约（Maximum Parsimony,MP）法
最小进化（Minimum Evolution ,ME）法
邻近归并（Neighbor Joining ，NJ）法
http://bbs.genecool.com/viewthread.php?tid=8918