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[版务管理] 基因酷保藏中心资源交换流程详细说明

本主题由 flashhyh 于 08-1-14 16:15 设置高亮 
武林三国

基因酷保藏中心资源交换流程详细说明

基因酷保藏中心资源交换流程说明


200804月15日)


1.预存或交换的酷友,请您先查看基因酷保藏中心资源列表,确认您预提供的资源对于基因酷是新颖的

2.您需要阅读基因酷生物保藏中心资源获取规则基因酷产品转让协议(GC MTA基因酷保藏中心鉴定工作的说明

3.请您在本版发布相应的预存或交换主题贴。

资源交换标准开贴:

题目:【交换资源(在发贴标题类型下拉菜单中选择即可)时间-您欲提供的资源名称-您的基因酷ID(昵称)-您所需要的资源名称或其在基因库的编号

例:

  【资源交换】20060918HCV CORE-鹏程万里-PET43a

  【资源交换】20060918PET32a-鹏程万里-PET43a

帖子内容:

    基因酷,您好!我是基因酷XXX(您的基因酷ID即昵称),我已认真阅读基因酷产品转让协议(GC MTA《资源保证协议》,并同意签署。我欲以XXX基因(或质粒、菌株,要写标准全称)交换基因库XXX基因(或质粒、菌株,请写标准全称)。请予以回复!

我预共享的功能基因(基因片段、质粒、菌株)基本信息:

  • 质粒需提供如下信息:
    载体名称:
    载体抗性:
    载体大小:
    载体宿主:
    载体特点:
    网站链接:介绍该载体的官方网址,如果提供的是改造基因还需提供介绍原始载体的官方网址。
    附件信息:附带载体的质粒图谱;若提供的是改造质粒,您还需要提供原始质粒的质粒图谱及改造后与原始载体相比的变化,尤其是酶切位点和融和蛋白的变化。

  • 功能基因(或基因片段)需提供如下信息:
    基因名称:(需要是该基因的全称,并注明该基因的确切来源)
    序列起止:
    连接载体:
    5`和3`端酶切位点:
    宿主:
    抗性:
    状态:
    Sequence:
    附件信息:附带WORD或DNASTAR版基因测序结果(包括目的基因序列和引物序列);基因所在的载体及克隆方法(引物上的酶切位点、克隆所用的酶切位点);如果您提供的基因为《基因酷生物保藏中心资源获取原则》“第五条基因库新基因认定原则”中第2款所述的“非全长基因区段”或者第3款所述的“您的基因短于基因库现有基因”的情况,您还需同时提交相关文章、专利或者您个人研究结果的电子版作为辅助材料已证明该基因的对基因库的“新颖性”;

  • 菌株需提供如下信息:
    菌株名称:
    菌株抗性:
    菌株特点:
    网站链接:介绍该菌株的官方网址
    附件信息:该菌株的相关介绍性文章一篇

注:附件信息指需要您以附件上传的方式提供的资料,资料可以是word或电子版。)

资源预存标准开贴:

题目:【预存资源(在发贴标题类型下拉菜单中选择即可)时间-您的基因酷ID(昵称)-您想要预存资源的名称

例:

【预存资源】20060918-鹏程万里-PET43a

帖子内容:

基因酷,您好!我是基因酷XXX(您的基因酷ID即昵称),我已认真阅读《资源保证协议》,并同意签署。我欲预存

XXX基因;

XXX质粒;

XXX菌株;

我预共享的功能基因(基因片段、质粒、菌株)基本信息:

(参见交换中需要您提供的功能基因、基因片段、质粒、菌株对应的信息)

请予以回复!

威望求助或酷币换取获取资源开帖:

题目:威望求助/酷币换取(在发贴标题类型下拉菜单中选择即可)时间-您的基因酷ID(昵称)-您所需要的资源名称或其在基因库的编号

例:

【威望求助】20060918-鹏程万里-PET43a

【酷币换取】20060918-鹏程万里-PET43a

帖子内容:

    基因酷,您好!我是基因酷XXX(您的基因酷ID即昵称),我已认真阅读基因酷产品转让协议(GC MTA并同意签署。我欲用威望求助(或酷币换取)获得基因库XXX基因(或质粒、菌株,请写标准全称),请予以回复!


4.请您将以下信息以站内短信息形式发给保藏中心。

一、个人信息包含内容如下:

  • 您的真实姓名:
  • 学习或工作单位:
  • 联系电话(包括手机):
  • QQMSN
  • E-mail:
  • 目前研究项目简介:(最少50字,主要说明项目的研究目的、难点和取得的结果。)
  • 邮寄地址和邮编:
    以上信息主要是为了更加及时的给您邮寄资源,以及对共享资源的有效跟踪。基因酷对您的私人信息绝对保密,敬请酷友放心!
二、资源基本信息包含内容如下:
  • 您对该资源的使用经历,主要包含该资源在您的实验室的使用频率;您的实验室最后一次使用该资源的日期,使用该资源的结果如何;如果可以希望您也能说明一下您使用该资源做过什么实验;
  • 您获取该资源的途径;
  • 对该资源您做过哪方面的验证工作,比如测序,表达,检测等;
    以上信息主要是为了配合保藏中心的鉴定工作。基因酷保证对这些信息的绝对保密,敬请酷友放心。

同时鼓励酷友同基因酷分享您的研究经历,共勉前进。您可以将:
1.目前研究项目的相关论文、文章或专利号;
2.课题研发简历(即您所从事过的研发项目名称和简介以及当时所在的单位,每个课题的简介最少50字,主要说明项目的研究目的、难点和取得的结果,最好能够付上相关论文、文章或专利号);
发到基因酷邮箱genecool@126.com。以上资料基因酷将绝对保密,敬请酷友放心!

5.基因酷对您的资料确认后,会在您发布的主题下面跟帖回复。并将基因酷的邮寄地址以站内短信息的方式发给您。

6.得到基因酷的肯定回复后,请将您的资源邮寄给基因酷。【注:若您预共享的资源是功能基因或基因片段资源,请您同时将上下游引物邮寄过来;如果您预共享的资源具有除卡那、氨苄、四环素、氯霉素、zeocin之外的抗性,请您同时将符合资源的抗生素邮寄过来;以上附加要求是为了便于基因酷保藏中心的鉴定工作,谢谢您的理解与支持!】。同时在您发表的主题下跟帖说明您已经邮寄了资源。(2008年04月15日修改)

7.基因酷收到资源后,会在论坛跟帖告知您,并安排相应的鉴定实验。

8.鉴定通过后,基因酷会第一时间邮寄出您需要的资源,及在论坛上跟帖回复告诉您邮递的时间,并将邮递单号站内短信给您。


9.收到资源后,请在您的主题贴下回复告知基因酷。对收到的资源有任何问题也请在主题贴下跟帖提出,基因酷会尽全力解决。


10.请您在基因酷保藏中心资源列表中对应的您从基因酷获得的资源主题下,跟帖说明如下信息:
  • 您对该资源的做过的鉴定工作(如测序,表达,检测等)的结果;
  • 您对该资源的使用情况给出客观的评价,即对资源的准确性给出说明;
    以上信息是为了便于酷友参考,希望您能积极配合。基因酷感谢您对保藏中心工作的大力支持!

基因酷生物保藏中心资源获取流程说明图



基因酷

2008年04月15日修改发布

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基因酷产品转让协议(GC MTA)

基因酷产品转让协议(GC MTA



    本协议是您(求助者)与基因酷(非盈利性基因质粒保藏中心)之间的一份合同。在向基因酷求助之前请阅读并同意本协议。
  • 您从基因酷获得的基因质粒等资源应仅用于实验室的科学研究,不能应用于不道德、非伦理的研究。在此条件下可进行相应的复制及繁衍。
  • 求助者承担资源在接收、处理、贮藏、存储、运送及使用过程中可能发生的各种风险责任,并应采取所有的安全措施及预防手段使其对健康及环境的影响最小化。
  • 求助者保证其对物质的处理、复制、繁衍符合相应的规则、法律、法规。
  • 在任何情况下求助者都不能将以上物质用于分销、销售或其它商业目的的运送及复制。
  • 复制的定义:是指对生物或化学物质的特性未进行实质性的更改下的物质数量上的增加,包括但不仅限于:质粒的转化与提取。
  • 繁衍的定义:是指对原有物质进行实质性的更改得到具有新特性的物质,包括但不仅限于:以基因酷提供的质粒载体或其中的基因片断进行重组DNA克隆。
  • 酷友共享基因资源的所有权由提供该资源的酷友拥有,同时委托基因酷生物资源保藏中心通过基因酷平台实行非盈利、公益性的共享。求助者承诺在相关的论文发表及专利申请时注明“XXX基因由基因酷(www.genecool.com)赠送!”或“XXX基因由基因酷(www.genecool.com)酷友XXX赠送!”

基因酷

2006年09月26日

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武林三国

推荐基因、大肠杆菌菌株资源的邮寄方式



基因质粒的邮寄和收获方法:
    为了安全和方便运输,建议同志们将质粒或基因等资源先点到膜上,风干后走EMS或挂号或其他快递公司投递。

  • 点膜:在滤纸(最好灭菌)上用铅笔画一直径0.2cm-0.4cm圈,将一定体积的质粒点在圈内(比如10ul),自然风干后置于自封袋中即可寄样;
  • 复溶:方法是将画圈的滤纸剪下,置于管中,加一定量的TE溶解(原则:够覆盖整个滤纸并最终能从中吸出10-20ul液体的量就行。),溶解30分钟后取出溶液。
  • 转化:方法是取5ul溶液做转化(步骤采用做普通连接物的转化)。
    还建议酷友们将基因导入通用载体(比如PET32aT载体等)后,以邮寄质粒的方式投递。

补充说明:
一、质粒邮寄和收获方法:
    将TE或双蒸水融解的液态质粒溶液约10-20ul(点在用铅笔画好的半径约为2毫米的洁净慢扩散型滤纸的圆心处,风干后放入干净的自封袋内置于4摄氏度冰箱内,1天内以快递方式邮寄。
二、  质粒邮寄和收获方法:
    收到滤纸后,将铅笔画有标记的部分(不含有铅笔笔迹部分)剪下后用干净的镊子夹入1.5mleppendoff离心管中用10-20ulTE或双蒸水充分融解,期间可用移液器反复吸打,最后12000rpm离心3-5分钟取上清5ul转化即可,同时该离心管保藏在-20摄氏度以备转化失败再次使用。

大肠杆菌菌株的邮寄和收获方法:
1. 穿刺保藏(推荐方法)
    穿刺保藏是个菌种保藏和运输的最佳选择,尤其是对于对宿主有特殊要求的质粒,方法很简单,就用培养该菌株的固体培养基融化后无菌状态下加入相应抗性后取500ul左右到1.5灭菌离心管中,冷却后用接种针沾取少量菌液穿入培养基内,选择不同穿刺入口反复几次后盖上盖子,在该菌株的适宜培养温度下培养1-12个小时,一般选择3小时即可(其实无所谓,就是菌复壮一下,和平板培养一样得道理,毕竟菌在运输过程中还会继续长)。随后封上封口膜,放在冰箱等待邮寄。
    收到后无菌条件下挖一块含有保藏菌株的培养物放到液体培养基里培养一定时间后画线分离单菌落即可。
2.甘油菌保藏
    甘油保藏也是菌株保藏和运输的常用方法,但保藏物为液体,不易邮寄且无法放置过久。具体保藏方法如下:
    在1.5ml离心管中取对数增长期菌液425ul加入的75ul的无菌甘油使甘油终浓度为15%,混匀后放置-70°保藏,邮寄前取出用手握住管底菌液迅速将其融化封上封口膜即可邮寄。

    收到后无菌条件转接菌株培养物到相应液体培养基里培养一定时间后画线分离单菌落即可。

注:为了防止交叉污染,建议一个资源用一张滤纸并用单独的自封袋
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基因酷保藏中心鉴定工作的说明

基因酷保藏中心鉴定工作的说明


    基因酷保藏中心对酷友共享资源的鉴定目前还只是属于初级鉴定,即通过资源的一些基本信息进行鉴定,没有通过测序或者更深入的分析鉴定,主要原因:一方面是我们现有的实验条件比较有限,另一方面我们没有足够的时间和资金。还望得到广大酷友的理解。
    为了避免共享资源的酷友误提供了错误的资源,并保障酷友从基因酷获取资源尽可能准确,现对保藏中心资源交换流程作如下调整:
一、预共享资源的酷友,请您对共享的资源提供如下信息:
  • 您对该资源的使用经历,主要包含该资源在您的实验室的使用频率;您的实验室最后一次使用该资源的日期,使用该资源的结果如何;如果可以希望您也能说明一下您使用该资源做过什么实验;
  • 您获取该资源的途径;
  • 对该资源您做过哪方面的验证工作,比如测序,表达,检测等;
  • 并同意签署《资源保证协议》;

《资源保证协议》

    您向基因酷提供的资源是真实有效的,如果该资源在酷友的正确使用时出现错误,或者经酷友鉴定该资源并非您所述提供的资源,您需免费再次提供该资源,直到提供了正确的资源为止,期间的所有邮寄及其他费用,由您一方提供。

二、从基因酷获取资源的酷友,请您对获取的资源提供如下信息:
    从基因酷获取资源的酷友,您需要分享您对该资源的使用经历,对该资源给出客观的评价,即对资源的准确性给出说明。随着酷友使用的评论增加,对资源的准确性会分出不同的等级,具体如下:一般有一个酷友证明了基因酷提供给他的资源是准确的,则说明这个资源是正确的,我们将评定该资源为中级鉴定;当有两个酷友证明该资源是准确的,我们将评定该资源为高级鉴定,即资源是正确无误的。
    酷友可以参考资源的评价,对资源进行一定的判断,并可选择性交换。如果酷友反馈某资源的效果不好,基因酷有义务联系共享此资源的酷友,共同解决问题。如该酷友不配合基因酷的工作,基因酷将在全坛发布公告,并删除该酷友的ID,该酷友也将不再有资格参与基因酷组织的任何实名的线上或线下活动。
    基因酷所有资源都用于科研领域,相信具有严谨科研态度的您,是不会为了一时所需而去欺骗同一战线上的其他科研人员的。为健全保藏中心的整个规则,以及更加透明化保藏中心的工作,基因酷对资源信息做了一个小小的补充,望广大酷友理解。
    希望大家通过基因酷构建一个健康、文明的资源共享平台,维护良好的科研环境!

注:根据说明已对《基因酷生物保藏中心资源获取规则》和《基因酷保藏中心资源交换流程说明》作出了相应的调整,请大家留心一下!
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武林三国
越来越完善了,作为一个公益机构,不容易啊!
努力会有结果!



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我们的好同志

基因酷通过自己的努力获得了大家的认可!
come on 基因库

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武林三国
希望论坛人气越来越好。

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论坛人气愈来愈旺,大力支持!

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武林三国
非常感谢!有基因酷,真好!

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狂顶

基因酷提前进入共产主义

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